Największa organizacja gwarantująca spokój i bezpieczeństwo wszechświata – Wspólnota Planet – rozpada się w wyniku zdrady jednej z ras (Nietzhean). Kapitan statku Andromeda – Dylan Hunt, dostawszy się w zasadzkę, rozkazuje załodze opuścić statek, sam zaś próbuje odciągnąć wrogą flotę. Niestety, Andromeda wpada w czarną dziurę. Po 300 latach poszukiwacze wraków wyciągają ją z osobliwości razem z Huntem, dla którego czas się zatrzymał. Zorientowawszy się, że wszystko co znał i kochał zostało zniszczone, a wszechświat jest nękany wojnami i wyzyskiem, postanawia przywrócić Wspólnotę Planet. W tym celu sprzymierzając się z nową załogą, wyrusza z misją, aby zachęcić inne światy do przyłączenia się.